Giuseppe D'Auria 
Considerando una specie microbica, il suo genoma si trova composto da un complesso di geni comuni a tutti gli isolati considerati, e un gruppo di geni accessori che rende speciale ognuno di loro. Questo abbordaggio allo studio della genomica a livello di specie, pernde il nome di pan-genoma.
Manuale d’installazione di un sistema Linux, distribuzione Xubuntu in un computer virtuale.
Storia dei metodi di caratterizzazione delle comunità microbiche attraverso l’evoluzione dei sequenziatori di DNA.
Identificare le varianti genomiche di SARS-CoV-2 e seguirle nel tempo e nello spazio è possibile grazie ai metodi di sequenziamento di seconda e terza generazione. Le sequenze genomiche ottenute vengono quindi confrontate con banche dati pubbliche alla ricerca delle mutazioni che definiscono varianti già conosciute o, eventualmente, descriverne delle nuove.
Il sequenziamento del DNA mediante metodi di seconda e terza generazione si presenta come una valida alternativa ai metodi classici di identificazione e diagnosi in microbiologia clinica.
L’analisi dell’enorme quantità di dati ottenuti con i nuovi metodi di sequenziamento rappresenta un nuovo collo di bottiglia nella ricerca scientifica. Oggigiorno è sempre più evidente la necessità di personale sempre più specializzato nell’analisi dei dati. I bioinformatici, a cavallo fra la biologia e l’informatica, si trovano attualmente in una posizione di favore. Rappresentando il culmine del lavoro scientifico trasformando i dati in risultati.